胰腺癌外显子测序新发现

胰腺癌是一种恶性程度很高，诊断和治疗都很困难的消化道恶性肿瘤，约90%为起源于腺管上皮的导管腺癌。其发病率和死亡率近年来明显上升。5年生存率1%，是预后最差的恶性肿瘤之一。

病因

胰腺癌的病因尚不十分清楚。其发生与吸烟、饮酒、高脂肪和高蛋白饮食、过量饮用咖啡、环境污染及遗传因素有关；近年来的调查报告发现糖尿病人群中胰腺癌的发病率明显高于普通人群；也有人注意到慢性胰腺炎病人与胰腺癌的发病存在一定关系，发现慢性胰腺炎病人发生胰腺癌的比例明显增高；另外还有许多因素与此病的发生有一定关系，如职业、环境、地理等。

治疗

目前根本的治疗原则仍然是以外科手术治疗为主，结合放化疗等综合治疗。

1.外科治疗

手术是惟一可能根治的方法。。

2.姑息治疗

对于不适合做根治性手术的病例，改善全身状态，一般生存时间在六个月左右。

3.综合治疗

现在的综合治疗仍然是以外科治疗为主，放疗、化疗为辅，并在探讨结合免疫和分子等生物治疗的新方法。

4.对症支持治疗

胰腺癌晚期，因胰腺外分泌功能不全，出现脂肪泻者，可于餐中服用胰酶制剂以帮助消化。对顽固性腹痛，给予镇痛药，包括阿片类镇痛剂；必要时用50%～75%乙醇行腹腔神经丛注射或交感神经切除术。放疗可使部分患者疼痛缓解。还应加强营养支持，改善营养状况。

治疗是胰腺癌的一大难题，SimmonsCancerCenter和UTSouthwesternMedicalCenter发表研究，通过外显子测序揭示胰腺癌的遗传多样性与治疗方式，为这类疾病的治疗提供一定的方法。

研究背景

胰腺导管癌(PDA)是一种预后效果非常差的恶性疾病，需要深入了解该疾病的病因并开发靶向治疗策略。PDA肿瘤中存在大量基质细胞和炎症细胞，因此对此病肿瘤样本进行肿瘤细胞测序比较困难。本研究为寻求该病基因遗传多样性，发现PDA治疗靶点提供重要信息。

研究材料

个PDA患者肿瘤单细胞样本。

实验结果

1.突变的筛选

从胰腺癌上切割有代表性部分，进行显子测序。从突变中筛选出各基因的多种突变情况，包括错义突变、无义突变、插入、可变剪切(图1)。

图1各基因的多种突变情况

2.拷贝数变异(CNV)

对测序的得到的对CNV进行分类(图2a)，发现5和6号群体与其他不同，具有较高的整体性，除了TP53基因，其余的基因发生了CNV缺失(图2b)。5和6号群体的生存率也比其他分类群体要低(图2c)。

图2拷贝数变异(CNV)

3.胰腺癌细胞基因的突变与预后的关系

对个样本的测序结果进行分析(图3a)。研究发现其中KRAS与TP53基因的SNV与InDel频率最高。选取了2个重要的基因，并通过分析发现，当RBM10基因产生变异之后，患者生存率比非突变的个体高很多，而ARID1A情况却相反(图3b)。

图3.PDA中存在的一些突变基因

4.KRAS通路上的基因遗传多样性

KRAS，BRAF，PIK3CA在各基因上的分布区域分别为12、13、61(图4a)。

对pERK进行染色发现KRAS在12区域上表达高于61区域上的表达(图4e)。

对细胞样本用PLX-药物(抗癌药威罗菲尼)进行处理，发现KRAS，BRAF及对照细胞pERK的情况不同，PL45(即KRAS突变)的表达量最高(图4f，4g)，发现BRAF突变的细胞对PLX-药物的敏感性最强。

信号通路中一些关键基因突变对细胞的生长增殖具有重要的影响，这些基因的频率改变，形成癌症的概率将大大增加。

图4.KRAS通路上的基因遗传多样性

研究结论

环境压力与DNA修复基因的改变具有相关性；CNV会靶向多个肿瘤抑制/致癌基因位点，通过测序分析鉴定得到了多个新的突变，对于治疗有着重要的指示作用；癌基因BRAF突变可以使得患者对抗癌药威罗菲尼的敏感性增强。综上所述本研究为这类疾病的治疗提供了一定的方法和思路。

参考文献

WitkiewiczAK,McMillanEA,BalajiU,etal.Whole-exomesequencingofpancreaticcancerdefinesgeneticdiversityandtherapeutictargets[J].NatureCommunications,,6.

文案：邢书娟

编辑：王倩